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09/2020

疫情下的全球科研互助:生化平台在行动

入秋后的苏州,碧空如洗,金桂飘香。来自牛津大学工程科学系的博士二年级研究生雷蕊已经在苏州度过了作为海外访问学生的第三个月。

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如果不是因为这场突如其来的全球新冠疫情,此时雷蕊应该在位于英国黑丁顿的生物医学工程研究所(Institute of Biomedical Engineering, IBME)的实验室进行自己的博士课题研究。自从年初英国疫情爆发后被疏散回国后,雷蕊先是在家中待了几个月,在国内实现复工复产后,她被转到位于苏州的牛津大学苏州高等研究院 (OSCAR) 作暑期访问学生。然而,由于英国第二波疫情卷土重来,原本计划于9月返回牛津的她不得不根据学校安排,继续在苏州完成整个学期的学业。

 

       雷蕊目前主要从事人骨髓间充质干细胞来源外泌体的研究工作。众所周知,进行外泌体研究首先要建立对于提取的外泌体的鉴定表征工作,其中非常重要的参考数据就是外泌体的粒径分布和浓度。当前研究者所使用的最主流的粒径测试设备是简称为 NTA 的纳米颗粒追踪分析仪,几乎每个批次的外泌体样品都会送到 NTA 上进行粒径分析。但目前 OSCAR 自己的实验室还没有配备这台设备,好在雷蕊和她的导师 Prof.Zhanfeng Cui 通过合作者联系到了与 OSCAR 一墙之隔的中科院纳米研究所生化平台,并欣喜地发现平台前不久刚好完成了 NTA 设备的装机,现在正在对外提供开放服务。于是,双方迅速达成协议,生化平台 NTA设备管理员沈叶老师向这位来自牛津大学的博士生提供了操作培训、并发放了上机卡。截至目前雷蕊已经陆续送测了3批外泌体样品。当被问及如何看待平台提供的仪器及相关服务时,雷蕊表示:“非常开心能够在距离实验室不到500米的中科院研究所就能够使用到开展课题必需的关键仪器,也感谢沈老师在仪器使用过程中提供的细心帮助。我发现在苏州做访问学生完全没有影响我的实验进度,甚至可能比我在牛津那些必须在实验室内保持两米间距的同学还要轻松一些。”雷蕊同时提到,不仅生化平台,同属纳米研究所的测试分析平台也为她的样品拍摄电镜照片提供了极大便利。

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图注:牛津大学苏州高研院外景。远处白色高层建筑为中科院苏州纳米所生化平台。

实际上,自从疫情爆发以来,生化平台已经陆续接到许多像雷蕊同学这样需要借助第三方平台来维持科研活动连续性的合作请求。以开通服务仅三个月的 NTA 设备为例,除牛津大学苏州高研院外,平台还接受了来自南京医科大学等多家外地单位的远程寄送样品测试的需求。虽然其中少不了来回沟通协调的繁琐环节,但一想到能够帮助大家重新恢复被疫情打乱甚至中断的实验工作,平台全体员工就感到十分欣慰。毕竟,作为一线科研工作者,不管相隔多远,我们的心意都是相通的,那就是:不管遇到什么样的困难,也要克服它们,把自己的研究做下去!

 

       在全球化时代,人类的命运从未像今天这样紧密相连。非常巧合的是,雷蕊在平台使用的这台 NTA设备正是产自英国马尔文公司,在疫情期间它越过半个地球来到苏州“安家落户”。谁能想到仅仅几个月后,它就能为英国高校的研究工作提供助力呢?在此我们深深感到,全球的科学研究活动也是一个共同体;在这个共同体内,来自不同国家、不同机构的研究者们既有你追我赶的竞争、又有携手并肩的互助,才是推进科学事业的最佳路线。

 

(生化平台感谢牛津大学博士生雷蕊女士接受我们的专访。题图:雷蕊(坐者)与生化平台沈叶老师在实验室进行NTA分析)


09

09/2020

一秒搞定WB成像!还不快来免费试用e-Blot?

说起western blot, 相信各位生物研究僧和研发攻城狮们都是百 (yao) 感 (ya) 交 (qie) 集(chi),毕竟谁没有为得到一张条带横平、泳道竖直、曝光恰如其分的胶图而在bench上百转千回、黯然神伤过呢?好在时光飞逝,2020年的我们有了新的利器—— e-Blot电子压片成像仪来帮助做好WB实验啦!这台国产科学仪器不仅拥有玲珑身材和神仙颜值,更有在自研超大面积芯片基础上取得的惊艳性能表现。发布仅一年,其研发企业易孛特光电技术有限公司就接连斩获第三届中国医疗器械创新创业大赛(精密测量专场)第一名、创客中国上海区总决赛第三(生物类第一)的佳绩。

在这里请各位看官不要误会小编,除非你是拥有全自动印迹设备的土豪,否则,实验人员把握好配胶、电泳、转膜、封闭、孵育、曝光等各个步骤的细节仍然是确保WB实验走向成功的王道。不过,如果在最后的拍照环节,检测仪器能带来比目前主流的冷CCD化学发光成像设备:

  • 高3个数量级的灵敏度;

  • 高2个数量级的定量范围;

  • 从分钟级压缩至秒级的曝光时间(95%情况下仅需1秒);

这样的性能表现,会不会令你在定量低丰度蛋白、珍稀样品、或表达水平差异极大的蛋白时信心倍增呢?此外,e-Blot 相对传统CCD成像仪,体积压缩为1/10,桌面占用减少为1/4,这对于寸土寸金的实验室空间无疑是一大额外的福利~

       那么,究竟e-Blot是怎样实现对进口CCD凝胶成像仪的超越的呢?原来,易孛特研发团队通过头脑风暴碰撞出了“将传统暗房压片法和CCD数字成像法各自的优势结合在一起”的idea, 并克服重重困难研制出了面积为现有CCD芯片137倍(!)的超大CMOS芯片并将western 膜直接贴在该感光器件上成像,省去了镜头和光路,理论上可采集所有发光信号(CCD成像仪在光路上的损失可达90%甚至更多),从而极大地提高了WB检测的灵敏度和定量范围(图1)。

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图1. 压片成像仪与传统CCD成像仪在拍摄 western 膜时的工作模式差异。(图源:易孛特科学仪器)

       千言万语,不如上手一试。今天,我们就把e-Blot Touch Imager请到了生化平台的实验室(图2),在接下来的一段时间里,欢迎各位感兴趣的同事、同学和企业用户带着自己的WB膜到D1224 前来免费试用本仪器!(来的时候可别忘了带上自己的发光液哦~)

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图2. e-Blot touch imager实拍—— 我身材虽小,但却拥有一颗硕大的“芯”!

作为本次demo的主办方,平台的同事们也忍不住亲自对e-Blot上手把玩一番 ——至于怎么玩?自然是拿一块新鲜制作的western膜上机实拍啦!下面就是她们第一次使用获得的图像,并同时使用平台已配备的Amersham Imager 600凝胶成像仪进行了head-to-head对比:

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图3. 平台使用e-Blot和AI600对同一western膜的成像结果对比,注意曝光时间。

       怎么样,是不是也想亲自来试用一下了呢?欲参与本次demo请在工作时段联系:郑老师,62872643,18015595729. 最后,祝大家实验顺利,早日征服western!

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07/2017

苏州纳米所-赛默飞科技有限公司首届”生物制药质谱分析培训班”圆满结束

基于全球领先的Q Exactive Orbitrap超高分辨质谱平台,中科院苏州纳米所生化平台与Thermo Fisher公司于20176月首次合作共同举办了华东地区首届“生物制药质谱分析培训班”,培训历时四天,201769日圆满结束。本次培训吸引到了来自上海、深圳、广东、浙江和江苏的高校和企业的共十余位学员前来参加。


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参加人员合照

本次培训班聘请了多位来自Thermo Fisher的资深应用专家及知名企业专家授课,采用小班授课、聚焦专题、精准辅导的方式。本次培训中,四位专家不仅系统地介绍了生物样品前处理、液相色谱-质谱的基本理论知识,同时围绕蛋白质药物的完整分子量分析、肽图、电荷异质性、寡糖、二硫键等方向重点展开,并介绍了生物制药专业软件BioPharma Finder的使用方法,此外延伸介绍了蛋白质药物代谢定量、高级结构分析等方面的最新研究进展,并针对越来越受到关注的HCP(残留宿主细胞蛋白)分析进行相关内容的培训。

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理论培训 

除理论教学外,专家结合生化平台的Q Exactive plusQrbitrap高分辨质谱平台现场对仪器操作和软件进行了演示。

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现场培训照片

 为巩固培训教学内容及对学员问题进行针对性的指导,培训最后留出了答疑及问题讨论时间。本次培训内容涉足广泛,精彩纷呈,满足了各方同仁的学习需求!学员更是积极响应,向专家提出各种专业的问题,大家在交流互动中在理论及专业方面得到了很大的提升。

今后纳米生化平台会继续为广大制药行业及科研单位提供更多学习和培训的机会,敬请关注!


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04/2017

生物制药质谱分析培训班开始报名啦

一、培训简介:

近年来,中国生物制药迅猛发展,新药研发带来的革新动力为生物制药行业带来前所未有的发展机遇。基于全球领先的Q Exactive Orbitrap超高分辨质谱平台,中科院苏州纳米所生化平台联合Thermo Fisher公司将于20176月首次共同举办华东地区首届“生物制药质谱分析培训班”,旨在为江浙沪乃至全国生物制药企业提供生物制药质谱分析培训服务,为质谱使用者和分析人员提供理论知识学习和上机实践的机会,并致力提高企业分析人员质谱数据分析能力。

本次培训会将邀请多位Thermo Fisher资深应用专家及知名企业专家授课,将重点围绕蛋白质药物的完整分子量分析、肽图、电荷异质性、寡糖、二硫键等方向展开,同时介绍生物制药专业软件BioPharma Finder的使用方法,另外将延伸介绍蛋白质药物代谢定量、高级结构分析等方面的最新研究进展,并针对越来越受到关注的HCP(残留宿主细胞蛋白)分析进行相关内容的培训。

二、培训特色:

内容:样品处理、质谱采集、数据处理、软件讲解、上机演示(课程安排请见下页)

讲师:行业内资深技术专家,10年以上蛋白质质谱经验。

教材:国内唯一的蛋白质药物分析中文教程。

授课:为保证学习质量,本次培训限定20人。

三、适用对象:

各制药企业、高校科研院所、CRO/CMO企业工程技术人员、分析人员

四、培训时间和地点

时间:201766日至9

地点:苏州 中科院苏州纳米所

席位有限,即刻报名!

主办:中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

协办:赛默飞世尔科技(中国)有限公司

培训具体安排如下

一、      培训课程安排

时间:66-9

地点:苏州纳米所D12D1204会议室


时 间

课 程

内 容

66

09:3012:00

理论讲座:质谱基础

质谱基本原理、分类、基本参数意义及常见专用名词解释

13:3016:00

仪器培训:单抗分子量测定

完整单抗样品处理、质谱校正、数据采集

软件培训:单抗分子量测定

全蛋白分子量数据分析

67

09:3012:00

理论讲座:质谱应用

分子量、肽图、修饰、二硫键、糖基化、ADCPEG化、蛋白代谢、de novo、氢氘交换

13:3016:00

操作培训:肽图样品处理

蛋白质药物的溶液酶切操作

仪器培训:肽图分析

肽图分析的液质方法设置

软件培训:肽图分析

使用软件进行肽图、突变、修饰分析

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09:3012:00

理论讲座:二硫键分析策略

二硫键实验设计

软件培训:二硫键

使用软件进行二硫键分析

13:3016:00

操作演示:寡糖分析

使用2AB标记法处理寡糖样品

软件培训:寡糖分析

使用软件进行寡糖分析

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09:3012:00

技术讲座

知名企业专家报告

技术讲座

理论讲座:HCP分析

HCP实验的设计思路、软件鉴定与验证

13:3016:00

软件培训:全面回顾

对培训涉及到的内容进行巩固、答疑

 

二、      培训时间及地点

1.     报到时间:65

       报到地点:苏州纳米所D座12楼商业洽谈区(中厅)

2.     会议时间:6月6-9日

        会议地点:苏州纳米所D12D1204会议室

3.     地址:苏州 苏州工业园区 独墅湖高教区若水路398


三、      培训报名

            报名方式:请有意参加培训研讨班的人员将报名回执表于5月26日前发送邮件至bsun2007@sinano.ac.cn,获得报名反馈后发送汇款凭证,视为报名成功。因名额有限,组织方将按报名先后顺序确定参训人员名单。

            联系人:(培训课程相关孙老师   电话:0512-62872940

 

报名回执表

序号

姓名

手机

单位

职务

邮件

感兴趣内容

1







2







3







备注:是否需要协助安排住宿(费用自理)  □      □ 


四、      培训费用

6000/(含培训费、教材费、午餐费),报名及汇款截止时间为526日。

苏州市企业报名享8折优惠。



汇款方式

开户名:中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所

开户行名称:工商银行苏州工业园区支行 

账号:1102020309000334622

注意事项:请务必在汇款时注明“单位+姓名+质谱培训班”,方便信息核对。


五、      食宿、交通

食宿:本次培训提供午间自助工作餐。住宿需自理,可选择书香世家(月亮湾店)/如家酒店(鲜橙广场店)等,如需协助请联系李老师(0512-62872792, qli2017@sinano.ac.cn)。

交通路线:外地学员可选择到达苏州园区火车站/苏州火车站/苏州高铁北站的火车至苏州,或选择到达上海虹桥/浦东/苏南硕放机场的航班,后搭乘机场大巴到达苏州。

乘车路线:乘坐156128路到中科院纳米所站下车即到;或地铁2号线(桑田岛方向)月亮湾站下车,步行1公里即到。

交通地图:


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04/2017

生化平台举办高通量细胞成像筛选应用讲座

[本文供稿:生化平台仪器部 郑克孝 / 濮科锋]


2017年3月31日,应纳米生化平台的邀请,美国 Nexcelom公司应用科学家章婷博士在苏州纳米所作了“Celigo? S在单抗研发中的应用”的专题讲座。本次报告会吸引了来自瑞阳生物、信达生物、东曜药业、迈博斯生物、吉玛基因等多家周边生物制药企业的研发人员到场参与。同时,主办方通过微信公众号 (“纳米生化平台”) 对此次讲座进行了现场直播,截止发稿时已有逾3500人次在线观看了该报告会。

 

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由美国 Nexcelom 公司出品的Celigo? S 是一款高通量全孔整板细胞成像筛选仪,为贴壁和悬浮细胞的研究提供了一种高通量,自动化,快速并且精准的分析模式。通过专利的扫描物镜光学设计和强大的分析软件,能够将细胞成像、分析和筛选的效率提升至前所未有的新高度。自问世以来,已经拥有一大批抗体药物研发明星企业用户,如 BMS,Genentech,NovoNordisk,Medimmune,Sonofi,Shire,Genmab,Selexis 等。

 

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报告会上,章婷博士结合多家企业和学术机构的实际应用案例,系统性地介绍了Celigo S在抗体药物研发中的应用,如在杂交瘤筛选过程中可用于Binding assay和抗体分泌检测、体外药效评价中可用于Bystander effect in Co-culture及3D瘤体杀伤、在单克隆筛选实验中可实现单细胞到单克隆的图像跟踪。章博士的精彩报告在现场引起热烈反响和讨论,会后有多家公司代表询问了预约Demo实验的相关事宜。

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生化平台将一如既往地为周边生物制药企业和医院的研发工作提供高技术支撑服务。本次讲座的主角 Celigo S 将于本月中下旬到平台实验室进行实机 demo 演示,欢迎感兴趣的企业和机构提前向生化平台预约 demo 实验(联系电话:62872940,姜老师),Nexcelom公司的应用科学家将依靠多年行业服务经验,为 demo 用户提供精心定制的实验方案,以保证最佳实验效果。